home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00476 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  33 lines
  1. **************************
  2. * Hemerythrins signature *
  3. **************************
  4.  
  5. Marine invertebrates such  as annelids or sipunculans  possess  two completely
  6. different types of oxygen binding  proteins: globins  which  are  found in the
  7. blood and hemerythrins which are found in the vascular system and the coelemic
  8. fluid or in muscles (myohemerythrins).  Hemerythrins and myohemerythrins [1,2]
  9. are small proteins of about 110 to 129 amino acid residues that bind two  iron
  10. atoms. Five  histidines, one glutamic acid  and one aspartic acid are involved
  11. in the binding of the iron atoms.
  12.  
  13. Ovohemerythrin [3], a yolk protein  from the leech Theromyzon tessulatum seems
  14. to belong to this family of proteins, it may play a role in the detoxification
  15. of free iron after a blood meal.
  16.  
  17. As a signature pattern we selected a region, located in the C-terminal section
  18. of these proteins and that  contains two of the iron-ligands: a histidine  and
  19. an aspartic acid.
  20.  
  21. -Consensus pattern: W-L-x-[NQ]-H-I-x(3)-D-F
  22.                     [H and D are iron ligands]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: December 1991 / First entry.
  26.  
  27. [ 1] Sheriff S., Hendrickson W.A., Smith J.L.
  28.      J. Mol. Biol. 197:273-296(1987).
  29. [ 2] Uchida T., Yano H., Satake K., Kubota I., Tsugita A.
  30.      Protein Seq. Data Anal. 3:141-147(1990).
  31. [ 3] Baert J.-L., Britel M., Sautiere P., Malecha J.
  32.      Eur. J. Biochem. 209:563-569(1992).
  33.